کتاب «شاه جعفر» ماجرای زندگی یونس، جوان نمک فروشی است که کارش، استخراج نمک از اطراف قم(دریاچه نمک) و فروش آن است. او عاشق عطیه، یکی از دخترهای دهکده جمکران شده و به هر دری می زند نمی تواند رضایت پدر دختر را بگیرد. با دعوای طایفه آنها و طایفه عطیه، اوضاع برایش سخت تر می شود.

امامزاده جعفر از بزرگان قم است، یونس قصد کمک گرفتن از شاه جعفر را دارد که خبر می رسد لشکر مغول، به فرماندهی امیرزاده جته نویان، در حال حمله به قم است. شهر بهم می ریزد و همه در تدارک دفاع می شوند. رهبری مبارزه به امامزاده جعفر سپرده می شود و به رهبری او، قرار می شود، دروازده ها بسته شود و حصار شهر مستحکم شود و در داخل شهر به دفاع برخیزند. مقدمات کار فراهم می شود. مغول ها به پشت دروازه های قم می رسند، اما با مقاومت قمی‌ها، در فتح شهر ناموفق است.